Трите основни направления в дейността на БХК са наблюдението на състоянието на правата на човека в България, застъпничеството и популаризирането на правозащитната идея и защитата на основните човешки права с правни средства. В организацията функционират отделни програми, ангажирани с всяко от тези направления.
Мониторинг и изследвания
Програмата извършва системно наблюдение и документиране на нарушенията на правата на човека в България.